او نوشت:
«آقایان محترم، شما حق ندارید ایران، مردمش و داشته‌هایش را با تحلیل‌های ایدئولوژیکی پوسیده و نادرست، به کام نابودی بکشانید!»
در بخش‌های دیگر این نامه، او مشروعیت حاکمیت را به‌چالش کشید و اعلام کرد: «به عنوان یک ایرانی، از شما می‌پرسم: چه کسی به شما این حق را داده که کشوری با این تاریخ و این مردم را قربانی رویاهای سیاسی خود کنید؟»
مهرآیین، در حرکتی بی‌سابقه، مردم را نیز فراخواند تا با پرچم‌های سفید و شعار «صلح با جهان» به خیابان‌ها بیایند و خواستار پایان جنگ و آغاز نظمی نوین برای آینده ایران شوند.
این بازداشت در حالی رخ داده که طبق گزارش‌ها، طی هفته گذشته بیش از ۱۰۰ نفر از فعالان و کنشگران مخالف جنگ با اسرائیل توسط نهادهای امنیتی جمهوری اسلامی بازداشت و روانه زندان شده‌اند؛ آماری که زنگ خطر گسترده‌تر شدن سرکوب‌ها را به صدا درآورده است.
مصطفی مهرآیین پیش از این نیز بارها در مقام یک روشنفکر مستقل، دست به افشاگری، نقد علنی حاکمیت و هشدار به سران کشور زده بود. تهدیدهای تلفنی، احضارهای امنیتی و ایجاد پرونده‌های قضایی علیه او در ماه‌های گذشته، نشان‌دهنده فشار فزاینده حکومت بر صداهای مستقل و منتقد است.
بازداشت این استاد دانشگاه، زنگ خطر تازه‌ای‌ست برای جامعه مدنی و دانشگاهی ایران؛ صدایی که به‌جای سکوت، فریاد کشید و حالا پشت میله‌های زندان است.